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对我们的血液也好、心脏也好等等都会引起发病从A到V的菌都是有益的。这里我们所常见的扁桃体都会存在链球菌A系列，这种系列对人体是有益的。当免疫力低下的情况下，A系列会大量繁殖，会引起扁桃体炎、感染、感冒等情况。所以链球菌是有益的，但是如果在菌群失调情况下也会引起致病。所以这种有益和致病之间没有一个绝对的界限在里头。再一个，人体之间好多细菌都是有益的，在一些条件改变的情况下，或者紊乱的情况下，有些原来对我们有益的细菌变成对我们有害的。很多细菌对我们都有害，只要进去。只有一部分细菌对我们是有益的，像大肠杆菌等等帮助我们消化，产生一些霉等等，或者一些唾液都可以帮助消化。但是在一些特定的情况下有益的菌群繁殖起来就会造成有害的情况。
大部分细菌是有益细菌，它们存在于食物，水和空气中，并在人与人之间传播。
嗜乳酸杆菌（Lactobacillus acidophilus）：这是一种最友好的细菌，属名是乳酸菌。这种益生菌自然存在于乳制品中，并且可以添加进饮食中获得最佳效果。
嗜酸乳杆菌（Tobacillus Acidophilus）：属于乳杆菌属，是一种喜酸细菌。可以在牛奶，酸奶，酸奶油及冰冻甜点中发现它们，由于能够转化成乳酸糖和碳水化合物，因此也称为乳酸菌。在降低pH值和减少食物中其他微生物的生长过程中，它会产生发酵味。这一过程对人类很有好处，因为它有预防胃肠道感染的作用。
氰钴胺（Cyanocobalamin）：这种细菌帮助消化过程中产生维生素B12。这种益生菌负责整体消化健康，它们分解食物复杂成分，以便于更容易被血液吸收。
乳酸菌加双叉乳杆菌（Acidophilus Bifidus）：这种细菌降低胆固醇水平，并防止白色念珠菌酵母生长。乳酸菌加双叉乳杆菌清洁血液并排除毒素，因此可以加强免疫系统。
链霉菌（Streptomyces）：链霉菌用于生产抗生素。
根瘤菌（Rhizobium）：在固氮方面扮演了重要角色。
大肠杆菌：存在于肠子，因此也称为肠道细菌。它们帮助消化并保持身体健康。这些细菌还产生复合维生素B和维生素K。
变形链球菌：这些是可以在口腔中发现的细菌，负责将蔗糖，糖转换成乳酸。
表皮葡萄球菌：可以在皮肤内发现，它们帮助阻止某些真菌传播。
嗜酸细菌：可以在阴道内发现，这些细菌产生乳酸，从而起到阻止真菌生长的作用。
肠菌类：肠道菌群在新细胞形成，肠道再生，膳食纤维发酵和生产脂肪酸方面发挥了重要作用。肠道细菌也产生一些人体所需维生素。
酵母菌：它有助于减少与抗生素有关的儿童腹泻风险。
厌氧有益细菌：厌氧细菌有利于醋的发酵和奶酪加工。
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