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海绵动物约有5000种，其中一半种类为化石，现存种类中仅有一个科，150种左右为淡水种，其他的均为海洋生活，从潮间带到9000m的深海均有分布，靠近河口处的海域往往更丰富，常有其优势种。许多海底泥沙环境生活的种类常与水流呈一定的角度附着。海绵动物由于其骨针及恶劣的腥臭味，很少被其他动物捕食。海绵动物与许多其他动物具有共生或寄生关系，例如在其宽阔的中央腔中可以为环节动物、节肢动物、线虫等提供居住场所，海绵动物也可附着在软体动物、甲壳动物体外，为它们提供保护。例如有的寄居蟹的螺壳除了壳口之外，完全被硅质的皮海绵（Suberites）所包围，一些穿贝海绵（Cliona）甚至在瓣鳃纲软体动物的壳上钻穴，使壳的内面充满穴道。许多种海绵动物与海葵等腔肠动物有共生关系，即海绵为海葵提供保护，海葵携带海绵移动，并易于从海葵的食物碎屑中获得食物。淡水海绵体内也共生有大量的藻类，可以为海绵动物提供部分补充营养，所以海绵动物常与其他动物组成一复杂的群落。现存的海绵动物可分为三个纲，即钙质海绵纲（Calcarea），六放海绵纲（Hexactinellida）和寻常海绵纲（Demospongiae）。
还有一些复沟型硬海绵，具硅质骨针及海绵丝形成网状，外面再沉积有碳酸钙形成硬质骨骼，分布在珊瑚礁的穴洞内，种类很少，有人将它们独立成硬质海绵纲（Sclerospongiae）。
关于海绵动物的分类地位目前尚有不同的看法。海绵动物没有消化腔及口，没有神经结构，也没有组织器官的分化，而细胞具有相当的原始性及独立性，这些特征说明了它的原始性。同时海绵动物的身体结构形成沟系，具有其他多细胞动物没有的领细胞，特别在一些海绵的发育中胚层的分化有逆转现象，按传统的观点认为海绵动物是很早与其他多细胞分离出来而独立进化的一支，因此是进化中的一个侧枝，由于海绵动物也不再进化成其他多细胞动物，所以也是进化中的一个盲枝。持这种观点的动物学家认为海绵动物是由原生动物中的领鞭毛虫类（Choanoflagellate）进化而来，主要依据是领细胞与领鞭毛虫在形态结构上的相似性。
1963年Tuzet提出了不同的看法，他认为海绵动物不应被看做是进化中的侧枝，而是像其他多细胞动物一样，也是动物进化主流中的一枝，并且由海绵动物进化到腔肠动物。因为他观察到领细胞并不局限于海绵动物及领鞭毛虫，而是在棘皮动物的幼虫中也存在。并且具有单个鞭毛的细胞在腔肠动物及其他后生动物的精子中普遍存在，扁平细胞及变形细胞也同样普遍存在，况且海绵动物与其他后生动物结缔组织中的胶原物质在化学与物理性质上相似。现存的硬海绵与腔肠动物的层孔虫类（Stromatoporidea）、刺珊瑚类（Chaetetida）也相似。另外，海绵动物幼虫的多样性意味着它的多重起源，这些特征说明海绵动物并不是一个侧枝，其身体的沟系结构是其固着生活方式所形成。总之，有关海绵动物在进化中的地位，是进化中的侧枝，抑或主支，尚待进一步的研究确定。
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